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福建醫科大學2021在全國本科院校排名第300位，強于第301名的內蒙古科技大學，第302名的大連大學，第303名的景德鎮陶瓷大學，第304名的中國人民公安大學，第305名的武漢工程大學。在福建排第7名，強于第8名的廈門理工學院，第9名的福建工程學院，第10名的福建中醫藥大學，第11名的閩南師范大學，第12名的閩江學院。

競爭力排名 年份 全國本科排名 院校名稱 省份 省內排名 2021 300 福建醫科大學 福建 7 2020 303 福建醫科大學 福建 7 2019 302 福建醫科大學 福建 7 2018 312 福建醫科大學 福建 7 2017 289 福建醫科大學 福建 7

綜合實力排名（校友會版）

在全國本科院校排名第245位，在福建排第7名。

校友會排名 年份 全國本科排名 院校名稱 省份 省內排名 2020 245 福建醫科大學 福建 7 2019 280 福建醫科大學 福建 7 2018 290 福建醫科大學 福建 7 2017 286 福建醫科大學 福建 7

綜合實力排名（軟科版）

在全國本科院校排名第154位，在福建排第4名。

軟科排名 年份 全國本科排名 院校名稱 省份 省內排名 2018 154 福建醫科大學 福建 4 2017 130 福建醫科大學 福建 4